Opetusta ohjaa koulun opetussuunnitelma. Opetussuunnitelmaan on kirjattu koulutyön tavoitteet, opiskeltavat sisällöt, käytettävät työtavat ja tarjottavat tukimuodot.

Poikkilaaksossa luokanopettajat toimivat työpareina, jotka suunnittelevat, toteuttavat ja arvioivat opetusta yhdessä. Heidän lisäkseen oppilaiden kanssa voi työskennellä työskennellä erityisopettaja tai koulunkäyntiavustaja. Oman kotiluokan lisäksi oppilaat voivat opiskella muissakin kokoonpanoissa.

Oppilaat saavat koulusta maksutta oppikirjat ja muun oppimateriaalin, jonka koulu itse valitsee.